MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcystis aeruginosa NIES-843 chromosome

Total Repeats: 21741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010296	AAG	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010296	TTA	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010296	T	6	6	3698	3703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010296	ATA	2	6	5930	5935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010296	GATT	2	8	6664	6671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010296	ACT	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010296	AAC	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010296	T	7	7	9435	9441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010296	GGTTG	2	10	9452	9461	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010296	AAT	2	6	9515	9520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010296	TTA	2	6	10046	10051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010296	ATT	2	6	10059	10064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010296	CTG	2	6	10090	10095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010296	TAT	2	6	10121	10126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010296	ATA	2	6	10191	10196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010296	T	7	7	10209	10215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010296	CTAA	2	8	12507	12514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010296	TAA	2	6	12556	12561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010296	A	6	6	12560	12565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010296	A	7	7	12572	12578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010296	A	6	6	15301	15306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010296	CAA	2	6	15323	15328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010296	TTC	2	6	15340	15345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010296	TAA	2	6	16530	16535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010296	T	7	7	16890	16896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010296	G	7	7	16992	16998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010296	AGA	2	6	19003	19008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010296	GT	3	6	19016	19021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010296	ACACAT	2	12	19281	19292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010296	CAA	2	6	19309	19314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010296	AGAA	2	8	19317	19324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010296	AATTA	2	10	21099	21108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010296	C	6	6	21130	21135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_010296	C	6	6	21138	21143	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_010296	G	6	6	21151	21156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010296	G	6	6	21168	21173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010296	TAA	2	6	21183	21188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010296	CCTA	2	8	21213	21220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010296	CTG	2	6	21282	21287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010296	GTT	2	6	22002	22007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010296	T	6	6	22006	22011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010296	TGA	2	6	22437	22442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010296	T	6	6	22934	22939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010296	T	6	6	23623	23628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010296	T	6	6	23721	23726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010296	ATTA	2	8	25029	25036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010296	AAT	2	6	25045	25050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010296	ATTT	2	8	25090	25097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010296	ACT	2	6	25104	25109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010296	TA	3	6	26555	26560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010296	CGC	2	6	26595	26600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010296	TA	3	6	26641	26646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010296	CGC	2	6	26681	26686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010296	GTT	2	6	26709	26714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010296	GCT	2	6	26748	26753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010296	GAA	2	6	26830	26835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010296	ATA	2	6	26848	26853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010296	GCAA	2	8	26902	26909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010296	TGG	2	6	27287	27292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010296	CT	3	6	27302	27307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010296	T	6	6	27331	27336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010296	TTCGA	2	10	27341	27350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010296	ATT	2	6	27588	27593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010296	CTCAAA	2	12	27668	27679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010296	ATG	2	6	27737	27742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010296	CA	3	6	29109	29114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010296	A	7	7	29122	29128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010296	CGA	2	6	29138	29143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010296	AAG	2	6	29147	29152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010296	TTGA	2	8	30007	30014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010296	ATT	2	6	30031	30036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010296	ATT	2	6	30079	30084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010296	GAT	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010296	AAT	2	6	31897	31902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010296	TAT	2	6	31915	31920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010296	ATTTT	2	10	32027	32036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010296	T	7	7	32228	32234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010296	GATC	2	8	32252	32259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010296	G	6	6	32272	32277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010296	TTAA	2	8	32543	32550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010296	ATTA	2	8	32551	32558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010296	CAT	2	6	32560	32565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010296	GGA	2	6	32567	32572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010296	A	6	6	32590	32595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010296	TGC	2	6	32610	32615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010296	TC	3	6	32645	32650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010296	GA	3	6	32876	32881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010296	AGA	2	6	32945	32950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010296	GAT	2	6	33030	33035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010296	TTC	2	6	33669	33674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010296	TTC	2	6	33704	33709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010296	CAA	2	6	33745	33750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010296	A	6	6	33771	33776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010296	AAG	2	6	33785	33790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010296	TAC	2	6	34237	34242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010296	TCT	3	9	34264	34272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010296	CAA	2	6	37199	37204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010296	ATTA	2	8	37677	37684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010296	AAC	2	6	37685	37690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010296	GAA	2	6	37701	37706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010296	A	6	6	38303	38308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010296	A	7	7	38709	38715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010296	TCT	2	6	38740	38745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010296	TCTTT	2	10	38769	38778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010296	T	6	6	38776	38781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010296	GAGT	2	8	38863	38870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010296	GGC	2	6	38872	38877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010296	TTG	2	6	38940	38945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010296	TTTGT	2	10	39001	39010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010296	CAA	2	6	40724	40729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010296	AG	3	6	40783	40788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010296	ACA	2	6	40804	40809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010296	TCT	2	6	40820	40825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010296	T	7	7	40841	40847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010296	T	6	6	40922	40927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010296	C	6	6	40947	40952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_010296	A	6	6	42472	42477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010296	TATAA	2	10	42520	42529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010296	A	7	7	42787	42793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010296	ATATTT	2	12	42798	42809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010296	GAAGC	2	10	42821	42830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010296	GAA	2	6	42860	42865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010296	AG	4	8	42882	42889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010296	TTA	2	6	42890	42895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010296	TC	3	6	42898	42903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010296	TGTT	2	8	42921	42928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010296	CTT	2	6	42953	42958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010296	GACT	2	8	43008	43015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010296	AAATT	2	10	43032	43041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010296	T	8	8	43066	43073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010296	A	6	6	43085	43090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010296	GTG	2	6	44274	44279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010296	GTA	2	6	44339	44344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010296	TAA	2	6	44381	44386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010296	GTCCT	2	10	44392	44401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010296	CTG	2	6	44428	44433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010296	A	8	8	44469	44476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010296	CAA	2	6	44853	44858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010296	CAA	2	6	44884	44889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010296	A	6	6	45168	45173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010296	CAA	2	6	45190	45195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010296	CAGC	2	8	45212	45219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010296	AGG	2	6	45227	45232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010296	ATT	2	6	45233	45238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010296	CTCA	2	8	45261	45268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010296	ATT	2	6	47596	47601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010296	AAC	2	6	47610	47615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010296	TTA	2	6	47849	47854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010296	AAT	2	6	47886	47891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010296	C	6	6	52347	52352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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179	NC_010296	CGG	2	6	55776	55781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_010296	ATA	2	6	57023	57028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010296	CTG	2	6	57169	57174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_010296	CTT	2	6	118762	118767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_010296	GTTAA	2	10	119223	119232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010296	AAC	2	6	119336	119341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_010296	AAG	2	6	119395	119400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_010296	AGA	2	6	120016	120021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_010296	TTTTG	2	10	120059	120068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
443	NC_010296	A	7	7	120075	120081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_010296	GAA	2	6	120093	120098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_010296	AATC	2	8	120583	120590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_010296	ATA	2	6	120703	120708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_010296	TGA	2	6	121732	121737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_010296	CAA	2	6	121745	121750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_010296	GA	3	6	121789	121794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
450	NC_010296	ATGTTT	2	12	121841	121852	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_010296	T	6	6	121850	121855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010296	ACA	2	6	121891	121896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_010296	GCGA	2	8	121904	121911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
454	NC_010296	TAG	2	6	122302	122307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_010296	A	6	6	122338	122343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_010296	TAAG	2	8	122345	122352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_010296	TAA	2	6	123080	123085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_010296	T	7	7	123117	123123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_010296	GAGT	2	8	124136	124143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
460	NC_010296	GGC	2	6	124145	124150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_010296	TTG	2	6	124213	124218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010296	TTTGT	2	10	124274	124283	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
463	NC_010296	CAA	2	6	125997	126002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_010296	C	6	6	126035	126040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
466	NC_010296	TCT	2	6	126266	126271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_010296	A	6	6	126281	126286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_010296	A	6	6	126581	126586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_010296	AT	3	6	126661	126666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_010296	TA	4	8	127152	127159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_010296	GAA	2	6	127171	127176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
477	NC_010296	TCA	2	6	127218	127223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_010296	TCA	2	6	127227	127232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
479	NC_010296	CTA	2	6	127275	127280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_010296	CTG	2	6	127391	127396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_010296	GTTAT	2	10	127400	127409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
483	NC_010296	AAT	2	6	128668	128673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_010296	TAT	2	6	128686	128691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_010296	ATTTT	2	10	128798	128807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_010296	ATT	2	6	128814	128819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_010296	ATT	2	6	130293	130298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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